Servicios Bioinformáticos Especializados

Más que correr un software, interpretamos la biología detrás de tus datos. Cubrimos todo el flujo de trabajo NGS.

Genómica (DNA-Seq)

  • Variant Calling: Detección precisa de SNPs, InDels y Variantes Estructurales (SVs) para líneas germinales y somáticas.
  • Ensamblaje de Genomas: Estrategias De Novo y mapeo contra referencia (Resequencing) para organismos modelo y no modelo.
  • Anotación Funcional: Priorización de variantes con impacto biológico o clínico (SnpEff, VEP).
  • Genómica Comparativa: Análisis de pangenomas y filogenómica evolutiva.

Transcriptómica (RNA-Seq)

  • Expresión Diferencial: Análisis robusto (DESeq2/EdgeR) para identificar genes clave entre condiciones experimentales.
  • Enriquecimiento Funcional: Gene Ontology (GO), KEGG pathways y GSEA para entender las rutas biológicas activas.
  • Single-Cell RNA-Seq: Clustering celular, identificación de marcadores y análisis de trayectorias (Pseudotime).
  • Isoformas & lncRNA: Descubrimiento de nuevos transcritos y ARNs no codificantes.

Metagenómica & Microbioma

  • Metabarcoding (Amplicon): Perfilado taxonómico de diversidad bacteriana (16S), fúngica (ITS) y eucariota (18S) usando QIIME2/DADA2.
  • Shotgun Metagenomics: Reconstrucción de genomas bacterianos (MAGs) y análisis de capacidad metabólica funcional.
  • Análisis de Resistoma: Detección y cuantificación de genes de resistencia a antibióticos (AMR) y factores de virulencia.

Visualización & Entrega

  • Figuras "Publication-Ready": Heatmaps, Volcano Plots, PCA y Diagramas de Venn en alta resolución (SVG/PDF/TIFF 300dpi).
  • Reportes Interactivos: Resultados entregados en formato HTML navegable (MultiQC) para facilitar tu exploración.
  • Soporte de Escritura: Redacción técnica detallada para la sección de "Materiales y Métodos" de tu paper.

Nuestro Flujo de Trabajo

Un proceso transparente diseñado para garantizar rigor científico desde el dato crudo hasta la publicación.

1. Validación de Calidad (QC)

Recibimos tus archivos y verificamos su integridad (FastQC). Aseguramos que tus datos valgan la pena ser analizados.

2. Estrategia Personalizada

Definimos contigo el diseño experimental. No aplicamos "recetas"; adaptamos el pipeline a tu pregunta biológica específica.

3. Análisis Reproducible

Ejecutamos el procesamiento usando estándares de la industria (Nextflow/Docker) para garantizar que tus resultados sean robustos y publicables.

4. Interpretación Biológica

Más allá de los gráficos, te acompañamos en la interpretación final. Cerramos con una reunión para discutir los hallazgos biológicos.

"Los tiempos y costos varían según la complejidad del genoma y el volumen de datos."